【动物全物种基因组测序“顾此失彼”】近日,美国华盛顿州立大学领导的一项研究发现,目前对动物基因组进行的测序多数集中在与人类相似的动物上。研究人员警告称,这会使人们忽视生物多样性和错失机会。相关成果发表于美国《国家科学院院刊》。

研究人员分析发现,近3300种动物的基因组已被测序。然而,与世界上166万种动物物种相比,这一数字还是很少,脊椎动物在目前的序列中占了绝大部分。数据显示,尽管脊椎动物只代表了3.9%的动物物种,但却占测序数据集的54%。相比之下,代表78.5%物种的节肢动物门无脊椎动物,只占当前数据集的34%。

“随着基因组数据集的迅速积累,我们会发现,目前数据集并不是均匀分布在动物生命树中。”研究作者、华盛顿州立大学博士后研究员Scott Hotaling认为,无脊椎动物仍然非常缺乏相关研究,因为人们似乎更关心脊椎动物。

研究通讯作者、美国杨百翰大学助理教授Paul Frandsen表示,要了解整个生态系统,必须对更多的生物进行采样。脊椎动物是生态系统的重要组成部分,但昆虫和许多其他小型生物可能发挥着更重要的作用,因为它们处于食物链的底端。

研究作者、华盛顿州立大学副教授Joanna Kelley还指出,目前绝大多数基因测序工作在发达国家开展,且大多数国家位于北半球,不同地区的测序工作也有特定的倾向。例如,北美国家对哺乳动物和昆虫进行了较多测序,欧洲国家、亚洲国家分别对鱼类和鸟类进行了较多测序。

近年来,几项大型的基因组测序工作启动,其中包括地球生物基因组计划。该计划设定了一个雄心勃勃的目标,在未来10年内对所有真核生物进行测序。

截至2021年6月,该计划已收集到3300多个动物基因组数据集。研究人员通过计算发现,以目前每天大约测序4个基因组的速度,要到3130年才能实现对所有真核生物进行测序的目标。

研究人员同时提出,促进该目标实现的一个方法是发展基础设施,并让更多来自南半球的国家,尤其是动物多样性丰富的热带地区的研究人员参与其中。http://t.cn/A6xlNGQX

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